Protein–RNA interactions for Protein: Q60778

Nfkbib, NF-kappa-B inhibitor beta, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbibQ60778 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NfkbibQ60778 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NfkbibQ60778 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NfkbibQ60778 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms