Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Csnk2a1Q60737 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms