Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CttnQ60598 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CttnQ60598 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CttnQ60598 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CttnQ60598 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CttnQ60598 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CttnQ60598 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CttnQ60598 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CttnQ60598 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CttnQ60598 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms