Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r195Q5SVD6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r195Q5SVD6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms