Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prune2Q52KR3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms