Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Brinp3Q499E0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Brinp3Q499E0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Brinp3Q499E0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Brinp3Q499E0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Brinp3Q499E0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Brinp3Q499E0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Brinp3Q499E0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Brinp3Q499E0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Brinp3Q499E0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Brinp3Q499E0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Brinp3Q499E0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Brinp3Q499E0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Brinp3Q499E0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Brinp3Q499E0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Brinp3Q499E0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Brinp3Q499E0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Brinp3Q499E0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Brinp3Q499E0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Brinp3Q499E0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Brinp3Q499E0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Brinp3Q499E0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Brinp3Q499E0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Brinp3Q499E0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Brinp3Q499E0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Brinp3Q499E0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Brinp3Q499E0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Brinp3Q499E0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Brinp3Q499E0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Brinp3Q499E0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Brinp3Q499E0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Brinp3Q499E0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Brinp3Q499E0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Brinp3Q499E0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Brinp3Q499E0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Brinp3Q499E0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Brinp3Q499E0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Brinp3Q499E0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Brinp3Q499E0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Brinp3Q499E0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Brinp3Q499E0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Brinp3Q499E0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Brinp3Q499E0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Brinp3Q499E0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Brinp3Q499E0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Brinp3Q499E0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Brinp3Q499E0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Brinp3Q499E0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms