Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5935Q497S0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5935Q497S0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms