Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0V0

Ldlrad2, Low density lipoprotein receptor A domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad2Q3V0V0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms