Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0F0

Rimbp3, RIMS-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rimbp3Q3V0F0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Rimbp3Q3V0F0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rimbp3Q3V0F0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rimbp3Q3V0F0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rimbp3Q3V0F0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rimbp3Q3V0F0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Rimbp3Q3V0F0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rimbp3Q3V0F0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rimbp3Q3V0F0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rimbp3Q3V0F0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rimbp3Q3V0F0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Rimbp3Q3V0F0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rimbp3Q3V0F0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rimbp3Q3V0F0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rimbp3Q3V0F0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rimbp3Q3V0F0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rimbp3Q3V0F0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rimbp3Q3V0F0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rimbp3Q3V0F0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Rimbp3Q3V0F0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rimbp3Q3V0F0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Rimbp3Q3V0F0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Rimbp3Q3V0F0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rimbp3Q3V0F0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rimbp3Q3V0F0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rimbp3Q3V0F0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rimbp3Q3V0F0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rimbp3Q3V0F0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rimbp3Q3V0F0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rimbp3Q3V0F0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Rimbp3Q3V0F0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rimbp3Q3V0F0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rimbp3Q3V0F0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rimbp3Q3V0F0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rimbp3Q3V0F0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rimbp3Q3V0F0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rimbp3Q3V0F0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rimbp3Q3V0F0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rimbp3Q3V0F0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rimbp3Q3V0F0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rimbp3Q3V0F0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rimbp3Q3V0F0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rimbp3Q3V0F0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rimbp3Q3V0F0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rimbp3Q3V0F0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rimbp3Q3V0F0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Rimbp3Q3V0F0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rimbp3Q3V0F0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rimbp3Q3V0F0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rimbp3Q3V0F0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rimbp3Q3V0F0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rimbp3Q3V0F0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rimbp3Q3V0F0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rimbp3Q3V0F0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rimbp3Q3V0F0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Rimbp3Q3V0F0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rimbp3Q3V0F0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rimbp3Q3V0F0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rimbp3Q3V0F0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rimbp3Q3V0F0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rimbp3Q3V0F0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rimbp3Q3V0F0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rimbp3Q3V0F0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rimbp3Q3V0F0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rimbp3Q3V0F0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rimbp3Q3V0F0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rimbp3Q3V0F0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rimbp3Q3V0F0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rimbp3Q3V0F0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rimbp3Q3V0F0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rimbp3Q3V0F0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rimbp3Q3V0F0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rimbp3Q3V0F0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Rimbp3Q3V0F0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Rimbp3Q3V0F0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Rimbp3Q3V0F0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rimbp3Q3V0F0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rimbp3Q3V0F0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rimbp3Q3V0F0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rimbp3Q3V0F0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rimbp3Q3V0F0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rimbp3Q3V0F0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rimbp3Q3V0F0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rimbp3Q3V0F0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rimbp3Q3V0F0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rimbp3Q3V0F0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rimbp3Q3V0F0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rimbp3Q3V0F0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rimbp3Q3V0F0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rimbp3Q3V0F0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rimbp3Q3V0F0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rimbp3Q3V0F0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rimbp3Q3V0F0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rimbp3Q3V0F0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rimbp3Q3V0F0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rimbp3Q3V0F0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rimbp3Q3V0F0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rimbp3Q3V0F0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rimbp3Q3V0F0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rimbp3Q3V0F0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms