Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mbd3l2Q3UXB0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms