Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sf3b2Q3UJB0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Sf3b2Q3UJB0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sf3b2Q3UJB0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sf3b2Q3UJB0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sf3b2Q3UJB0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sf3b2Q3UJB0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sf3b2Q3UJB0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sf3b2Q3UJB0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sf3b2Q3UJB0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sf3b2Q3UJB0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sf3b2Q3UJB0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sf3b2Q3UJB0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sf3b2Q3UJB0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sf3b2Q3UJB0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sf3b2Q3UJB0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sf3b2Q3UJB0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sf3b2Q3UJB0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sf3b2Q3UJB0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sf3b2Q3UJB0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sf3b2Q3UJB0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sf3b2Q3UJB0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sf3b2Q3UJB0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sf3b2Q3UJB0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sf3b2Q3UJB0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sf3b2Q3UJB0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sf3b2Q3UJB0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sf3b2Q3UJB0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sf3b2Q3UJB0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms