Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zswim8Q3UHH1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zswim8Q3UHH1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zswim8Q3UHH1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zswim8Q3UHH1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Zswim8Q3UHH1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Zswim8Q3UHH1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zswim8Q3UHH1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Zswim8Q3UHH1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms