Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vars2Q3U2A8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vars2Q3U2A8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vars2Q3U2A8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vars2Q3U2A8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vars2Q3U2A8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vars2Q3U2A8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vars2Q3U2A8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vars2Q3U2A8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vars2Q3U2A8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vars2Q3U2A8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vars2Q3U2A8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vars2Q3U2A8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vars2Q3U2A8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Vars2Q3U2A8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vars2Q3U2A8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vars2Q3U2A8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vars2Q3U2A8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Vars2Q3U2A8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vars2Q3U2A8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vars2Q3U2A8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vars2Q3U2A8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Vars2Q3U2A8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Vars2Q3U2A8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vars2Q3U2A8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vars2Q3U2A8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vars2Q3U2A8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vars2Q3U2A8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vars2Q3U2A8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vars2Q3U2A8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vars2Q3U2A8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Vars2Q3U2A8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vars2Q3U2A8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vars2Q3U2A8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vars2Q3U2A8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vars2Q3U2A8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vars2Q3U2A8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Vars2Q3U2A8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vars2Q3U2A8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vars2Q3U2A8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vars2Q3U2A8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vars2Q3U2A8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vars2Q3U2A8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vars2Q3U2A8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vars2Q3U2A8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vars2Q3U2A8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vars2Q3U2A8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vars2Q3U2A8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vars2Q3U2A8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vars2Q3U2A8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vars2Q3U2A8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vars2Q3U2A8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vars2Q3U2A8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vars2Q3U2A8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vars2Q3U2A8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vars2Q3U2A8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vars2Q3U2A8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vars2Q3U2A8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vars2Q3U2A8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vars2Q3U2A8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vars2Q3U2A8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vars2Q3U2A8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vars2Q3U2A8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vars2Q3U2A8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vars2Q3U2A8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vars2Q3U2A8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vars2Q3U2A8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Vars2Q3U2A8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vars2Q3U2A8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vars2Q3U2A8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Vars2Q3U2A8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vars2Q3U2A8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vars2Q3U2A8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Vars2Q3U2A8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vars2Q3U2A8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vars2Q3U2A8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vars2Q3U2A8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vars2Q3U2A8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vars2Q3U2A8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Vars2Q3U2A8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Vars2Q3U2A8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vars2Q3U2A8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vars2Q3U2A8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vars2Q3U2A8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vars2Q3U2A8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vars2Q3U2A8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vars2Q3U2A8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vars2Q3U2A8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vars2Q3U2A8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vars2Q3U2A8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vars2Q3U2A8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vars2Q3U2A8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vars2Q3U2A8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vars2Q3U2A8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vars2Q3U2A8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Vars2Q3U2A8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vars2Q3U2A8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vars2Q3U2A8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vars2Q3U2A8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vars2Q3U2A8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms