Protein–RNA interactions for Protein: Q3TEA8

Hp1bp3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hp1bp3Q3TEA8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hp1bp3Q3TEA8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hp1bp3Q3TEA8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hp1bp3Q3TEA8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hp1bp3Q3TEA8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hp1bp3Q3TEA8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hp1bp3Q3TEA8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hp1bp3Q3TEA8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hp1bp3Q3TEA8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hp1bp3Q3TEA8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hp1bp3Q3TEA8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hp1bp3Q3TEA8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hp1bp3Q3TEA8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hp1bp3Q3TEA8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hp1bp3Q3TEA8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hp1bp3Q3TEA8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hp1bp3Q3TEA8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hp1bp3Q3TEA8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hp1bp3Q3TEA8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hp1bp3Q3TEA8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hp1bp3Q3TEA8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hp1bp3Q3TEA8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hp1bp3Q3TEA8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hp1bp3Q3TEA8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hp1bp3Q3TEA8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hp1bp3Q3TEA8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hp1bp3Q3TEA8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms