Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccbe1Q3MI99 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccbe1Q3MI99 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccbe1Q3MI99 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms