Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Fam171bQ14CH0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fam171bQ14CH0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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