Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd3Q14AI6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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Rpusd3Q14AI6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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Rpusd3Q14AI6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpusd3Q14AI6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms