Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Lrriq1Q0P5X1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Lrriq1Q0P5X1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Lrriq1Q0P5X1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Lrriq1Q0P5X1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Lrriq1Q0P5X1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Lrriq1Q0P5X1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Lrriq1Q0P5X1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Lrriq1Q0P5X1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Lrriq1Q0P5X1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Lrriq1Q0P5X1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Lrriq1Q0P5X1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Lrriq1Q0P5X1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Lrriq1Q0P5X1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Lrriq1Q0P5X1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Lrriq1Q0P5X1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Lrriq1Q0P5X1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Lrriq1Q0P5X1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
Lrriq1Q0P5X1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Lrriq1Q0P5X1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Lrriq1Q0P5X1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Lrriq1Q0P5X1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Lrriq1Q0P5X1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Lrriq1Q0P5X1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Lrriq1Q0P5X1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Lrriq1Q0P5X1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Lrriq1Q0P5X1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Lrriq1Q0P5X1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Lrriq1Q0P5X1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Lrriq1Q0P5X1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Lrriq1Q0P5X1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Lrriq1Q0P5X1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Lrriq1Q0P5X1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Lrriq1Q0P5X1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Lrriq1Q0P5X1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Lrriq1Q0P5X1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Lrriq1Q0P5X1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Lrriq1Q0P5X1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Lrriq1Q0P5X1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Lrriq1Q0P5X1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Lrriq1Q0P5X1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Lrriq1Q0P5X1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Lrriq1Q0P5X1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Lrriq1Q0P5X1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Lrriq1Q0P5X1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Lrriq1Q0P5X1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Lrriq1Q0P5X1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Lrriq1Q0P5X1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Lrriq1Q0P5X1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Lrriq1Q0P5X1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Lrriq1Q0P5X1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Lrriq1Q0P5X1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Lrriq1Q0P5X1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Lrriq1Q0P5X1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Lrriq1Q0P5X1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Lrriq1Q0P5X1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Lrriq1Q0P5X1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Lrriq1Q0P5X1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Lrriq1Q0P5X1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Lrriq1Q0P5X1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Lrriq1Q0P5X1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Lrriq1Q0P5X1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Lrriq1Q0P5X1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Lrriq1Q0P5X1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Lrriq1Q0P5X1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Lrriq1Q0P5X1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Lrriq1Q0P5X1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Lrriq1Q0P5X1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Lrriq1Q0P5X1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Lrriq1Q0P5X1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Lrriq1Q0P5X1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Lrriq1Q0P5X1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC33.07■■■□□ 2.89
Lrriq1Q0P5X1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Lrriq1Q0P5X1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.89
Lrriq1Q0P5X1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Lrriq1Q0P5X1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Lrriq1Q0P5X1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Lrriq1Q0P5X1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Lrriq1Q0P5X1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Lrriq1Q0P5X1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Lrriq1Q0P5X1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Lrriq1Q0P5X1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Lrriq1Q0P5X1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Lrriq1Q0P5X1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Lrriq1Q0P5X1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Lrriq1Q0P5X1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Lrriq1Q0P5X1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Lrriq1Q0P5X1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Lrriq1Q0P5X1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Lrriq1Q0P5X1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Lrriq1Q0P5X1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Lrriq1Q0P5X1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Lrriq1Q0P5X1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Lrriq1Q0P5X1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Lrriq1Q0P5X1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Lrriq1Q0P5X1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Lrriq1Q0P5X1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Lrriq1Q0P5X1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Lrriq1Q0P5X1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms