Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Znf541Q0GGX2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Znf541Q0GGX2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Znf541Q0GGX2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Znf541Q0GGX2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Znf541Q0GGX2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Znf541Q0GGX2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Znf541Q0GGX2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Znf541Q0GGX2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Znf541Q0GGX2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Znf541Q0GGX2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Znf541Q0GGX2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Znf541Q0GGX2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Znf541Q0GGX2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Znf541Q0GGX2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Znf541Q0GGX2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Znf541Q0GGX2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Znf541Q0GGX2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Znf541Q0GGX2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Znf541Q0GGX2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Znf541Q0GGX2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Znf541Q0GGX2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Znf541Q0GGX2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Znf541Q0GGX2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Znf541Q0GGX2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Znf541Q0GGX2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Znf541Q0GGX2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Znf541Q0GGX2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Znf541Q0GGX2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Znf541Q0GGX2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Znf541Q0GGX2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Znf541Q0GGX2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Znf541Q0GGX2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Znf541Q0GGX2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Znf541Q0GGX2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Znf541Q0GGX2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Znf541Q0GGX2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Znf541Q0GGX2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Znf541Q0GGX2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms