Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nf1Q04690 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms