Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PrkczQ02956 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkczQ02956 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkczQ02956 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkczQ02956 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkczQ02956 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkczQ02956 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkczQ02956 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkczQ02956 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkczQ02956 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkczQ02956 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkczQ02956 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkczQ02956 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkczQ02956 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkczQ02956 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkczQ02956 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkczQ02956 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkczQ02956 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkczQ02956 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkczQ02956 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkczQ02956 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkczQ02956 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkczQ02956 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkczQ02956 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkczQ02956 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkczQ02956 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkczQ02956 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkczQ02956 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkczQ02956 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkczQ02956 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkczQ02956 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkczQ02956 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkczQ02956 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkczQ02956 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkczQ02956 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkczQ02956 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkczQ02956 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkczQ02956 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkczQ02956 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkczQ02956 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkczQ02956 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkczQ02956 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
PrkczQ02956 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.4 ms