Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.01■■□□□ 1.76
Cacna1sQ02789 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cacna1sQ02789 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cacna1sQ02789 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms