Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col6a2Q02788 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col6a2Q02788 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms