Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nhlh1Q02576 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nhlh1Q02576 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nhlh1Q02576 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nhlh1Q02576 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nhlh1Q02576 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nhlh1Q02576 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nhlh1Q02576 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nhlh1Q02576 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nhlh1Q02576 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nhlh1Q02576 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nhlh1Q02576 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nhlh1Q02576 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nhlh1Q02576 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nhlh1Q02576 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nhlh1Q02576 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nhlh1Q02576 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nhlh1Q02576 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nhlh1Q02576 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nhlh1Q02576 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nhlh1Q02576 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nhlh1Q02576 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nhlh1Q02576 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nhlh1Q02576 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nhlh1Q02576 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms