Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sec23aQ01405 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sec23aQ01405 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms