Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lig3P97386 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lig3P97386 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lig3P97386 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lig3P97386 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lig3P97386 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lig3P97386 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lig3P97386 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lig3P97386 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lig3P97386 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lig3P97386 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lig3P97386 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lig3P97386 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lig3P97386 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lig3P97386 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lig3P97386 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lig3P97386 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lig3P97386 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lig3P97386 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lig3P97386 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lig3P97386 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lig3P97386 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lig3P97386 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lig3P97386 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lig3P97386 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lig3P97386 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms