Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vgll3P85442 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vgll3P85442 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms