Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tubg1P83887 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms