Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chl1P70232 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chl1P70232 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chl1P70232 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Chl1P70232 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chl1P70232 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chl1P70232 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chl1P70232 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chl1P70232 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chl1P70232 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Chl1P70232 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Chl1P70232 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chl1P70232 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms