Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrch1P62046 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrch1P62046 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrch1P62046 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrch1P62046 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrch1P62046 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrch1P62046 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrch1P62046 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrch1P62046 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrch1P62046 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrch1P62046 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrch1P62046 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrch1P62046 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrch1P62046 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrch1P62046 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrch1P62046 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrch1P62046 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrch1P62046 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrch1P62046 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrch1P62046 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrch1P62046 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrch1P62046 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrch1P62046 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrch1P62046 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrch1P62046 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrch1P62046 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrch1P62046 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrch1P62046 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrch1P62046 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrch1P62046 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrch1P62046 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrch1P62046 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrch1P62046 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrch1P62046 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrch1P62046 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lrch1P62046 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrch1P62046 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrch1P62046 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrch1P62046 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrch1P62046 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrch1P62046 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrch1P62046 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrch1P62046 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrch1P62046 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrch1P62046 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrch1P62046 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrch1P62046 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrch1P62046 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrch1P62046 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrch1P62046 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrch1P62046 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrch1P62046 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrch1P62046 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrch1P62046 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrch1P62046 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrch1P62046 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrch1P62046 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrch1P62046 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrch1P62046 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrch1P62046 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrch1P62046 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrch1P62046 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrch1P62046 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrch1P62046 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrch1P62046 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrch1P62046 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrch1P62046 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrch1P62046 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrch1P62046 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrch1P62046 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrch1P62046 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrch1P62046 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrch1P62046 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrch1P62046 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrch1P62046 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrch1P62046 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrch1P62046 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrch1P62046 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrch1P62046 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrch1P62046 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrch1P62046 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrch1P62046 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrch1P62046 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrch1P62046 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrch1P62046 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrch1P62046 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrch1P62046 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrch1P62046 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrch1P62046 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrch1P62046 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrch1P62046 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrch1P62046 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrch1P62046 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrch1P62046 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrch1P62046 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrch1P62046 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrch1P62046 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrch1P62046 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrch1P62046 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrch1P62046 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms