Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Polr2fP61219 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2fP61219 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Polr2fP61219 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Polr2fP61219 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Polr2fP61219 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Polr2fP61219 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2fP61219 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2fP61219 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2fP61219 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2fP61219 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2fP61219 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2fP61219 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2fP61219 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2fP61219 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2fP61219 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2fP61219 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2fP61219 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2fP61219 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2fP61219 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2fP61219 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2fP61219 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2fP61219 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2fP61219 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2fP61219 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2fP61219 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Polr2fP61219 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr2fP61219 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr2fP61219 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Polr2fP61219 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms