Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hps5P59438 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hps5P59438 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hps5P59438 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hps5P59438 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hps5P59438 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hps5P59438 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hps5P59438 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hps5P59438 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hps5P59438 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hps5P59438 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hps5P59438 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hps5P59438 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hps5P59438 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms