Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P58686 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P58686 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P58686 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P58686 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P58686 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P58686 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P58686 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P58686 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P58686 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P58686 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P58686 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P58686 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P58686 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P58686 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P58686 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P58686 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P58686 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P58686 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P58686 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
P58686 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P58686 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P58686 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P58686 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P58686 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P58686 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P58686 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P58686 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P58686 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P58686 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P58686 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P58686 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P58686 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P58686 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P58686 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P58686 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P58686 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
P58686 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P58686 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P58686 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P58686 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P58686 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P58686 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
P58686 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P58686 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P58686 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P58686 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P58686 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P58686 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P58686 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
P58686 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P58686 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
P58686 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
P58686 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P58686 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
P58686 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
P58686 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
P58686 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P58686 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P58686 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P58686 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P58686 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
P58686 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P58686 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P58686 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P58686 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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P58686 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P58686 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P58686 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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P58686 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
P58686 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
P58686 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
P58686 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P58686 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P58686 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P58686 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
P58686 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P58686 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P58686 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
P58686 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P58686 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
P58686 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P58686 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P58686 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
P58686 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P58686 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P58686 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P58686 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P58686 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P58686 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
P58686 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P58686 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P58686 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
P58686 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P58686 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
P58686 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P58686 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P58686 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms