Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ephb4P54761 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ephb4P54761 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.4 ms