Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apobec1P51908 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apobec1P51908 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms