Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnt2P50752 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnt2P50752 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnt2P50752 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnt2P50752 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnt2P50752 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnt2P50752 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnt2P50752 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnt2P50752 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnt2P50752 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnt2P50752 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnt2P50752 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnt2P50752 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnt2P50752 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnt2P50752 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnt2P50752 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnt2P50752 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnt2P50752 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnt2P50752 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnt2P50752 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnt2P50752 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnt2P50752 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnt2P50752 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnt2P50752 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnnt2P50752 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt2P50752 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms