Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Defa-rs12P50716 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Defa-rs12P50716 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Defa-rs12P50716 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Defa-rs12P50716 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms