Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TspoP50637 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TspoP50637 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TspoP50637 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TspoP50637 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TspoP50637 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TspoP50637 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TspoP50637 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TspoP50637 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TspoP50637 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TspoP50637 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TspoP50637 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TspoP50637 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TspoP50637 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TspoP50637 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TspoP50637 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TspoP50637 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TspoP50637 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TspoP50637 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TspoP50637 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TspoP50637 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TspoP50637 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TspoP50637 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TspoP50637 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TspoP50637 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TspoP50637 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TspoP50637 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TspoP50637 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TspoP50637 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TspoP50637 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TspoP50637 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TspoP50637 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TspoP50637 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TspoP50637 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TspoP50637 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TspoP50637 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TspoP50637 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TspoP50637 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TspoP50637 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TspoP50637 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TspoP50637 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TspoP50637 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TspoP50637 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TspoP50637 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TspoP50637 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TspoP50637 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TspoP50637 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TspoP50637 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TspoP50637 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TspoP50637 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TspoP50637 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TspoP50637 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TspoP50637 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TspoP50637 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TspoP50637 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TspoP50637 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TspoP50637 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TspoP50637 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TspoP50637 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TspoP50637 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TspoP50637 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TspoP50637 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
TspoP50637 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TspoP50637 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TspoP50637 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TspoP50637 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TspoP50637 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TspoP50637 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TspoP50637 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TspoP50637 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TspoP50637 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TspoP50637 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TspoP50637 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TspoP50637 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TspoP50637 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TspoP50637 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TspoP50637 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TspoP50637 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TspoP50637 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TspoP50637 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TspoP50637 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TspoP50637 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TspoP50637 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TspoP50637 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TspoP50637 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TspoP50637 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TspoP50637 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TspoP50637 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TspoP50637 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TspoP50637 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TspoP50637 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TspoP50637 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TspoP50637 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TspoP50637 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TspoP50637 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TspoP50637 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TspoP50637 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TspoP50637 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TspoP50637 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TspoP50637 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms