Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxc13P50207 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms