Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VegfbP49766 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VegfbP49766 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VegfbP49766 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VegfbP49766 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VegfbP49766 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VegfbP49766 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VegfbP49766 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VegfbP49766 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VegfbP49766 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VegfbP49766 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VegfbP49766 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VegfbP49766 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VegfbP49766 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VegfbP49766 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VegfbP49766 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VegfbP49766 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VegfbP49766 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VegfbP49766 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VegfbP49766 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VegfbP49766 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VegfbP49766 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VegfbP49766 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VegfbP49766 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VegfbP49766 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VegfbP49766 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VegfbP49766 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VegfbP49766 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VegfbP49766 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VegfbP49766 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VegfbP49766 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VegfbP49766 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VegfbP49766 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VegfbP49766 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VegfbP49766 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VegfbP49766 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VegfbP49766 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VegfbP49766 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VegfbP49766 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VegfbP49766 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VegfbP49766 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VegfbP49766 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VegfbP49766 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VegfbP49766 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VegfbP49766 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VegfbP49766 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
VegfbP49766 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VegfbP49766 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VegfbP49766 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VegfbP49766 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VegfbP49766 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VegfbP49766 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VegfbP49766 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VegfbP49766 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VegfbP49766 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VegfbP49766 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VegfbP49766 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VegfbP49766 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VegfbP49766 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VegfbP49766 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VegfbP49766 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VegfbP49766 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VegfbP49766 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VegfbP49766 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VegfbP49766 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VegfbP49766 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
VegfbP49766 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VegfbP49766 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VegfbP49766 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VegfbP49766 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VegfbP49766 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VegfbP49766 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VegfbP49766 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VegfbP49766 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VegfbP49766 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VegfbP49766 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VegfbP49766 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VegfbP49766 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VegfbP49766 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VegfbP49766 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VegfbP49766 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VegfbP49766 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VegfbP49766 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VegfbP49766 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VegfbP49766 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VegfbP49766 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VegfbP49766 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VegfbP49766 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VegfbP49766 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VegfbP49766 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VegfbP49766 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VegfbP49766 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VegfbP49766 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VegfbP49766 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VegfbP49766 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VegfbP49766 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VegfbP49766 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VegfbP49766 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VegfbP49766 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VegfbP49766 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms