Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnni3P48787 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnni3P48787 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnni3P48787 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms