Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LtbP41155 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LtbP41155 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LtbP41155 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LtbP41155 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LtbP41155 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LtbP41155 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LtbP41155 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LtbP41155 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LtbP41155 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LtbP41155 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LtbP41155 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LtbP41155 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LtbP41155 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LtbP41155 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LtbP41155 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LtbP41155 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LtbP41155 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LtbP41155 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LtbP41155 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LtbP41155 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LtbP41155 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LtbP41155 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LtbP41155 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LtbP41155 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LtbP41155 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LtbP41155 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LtbP41155 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LtbP41155 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LtbP41155 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LtbP41155 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LtbP41155 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LtbP41155 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LtbP41155 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LtbP41155 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LtbP41155 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LtbP41155 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LtbP41155 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LtbP41155 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LtbP41155 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LtbP41155 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LtbP41155 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LtbP41155 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LtbP41155 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LtbP41155 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LtbP41155 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LtbP41155 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LtbP41155 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LtbP41155 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LtbP41155 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LtbP41155 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LtbP41155 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LtbP41155 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LtbP41155 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LtbP41155 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LtbP41155 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LtbP41155 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LtbP41155 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LtbP41155 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LtbP41155 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LtbP41155 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LtbP41155 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LtbP41155 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LtbP41155 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LtbP41155 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LtbP41155 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LtbP41155 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LtbP41155 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LtbP41155 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LtbP41155 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LtbP41155 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LtbP41155 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LtbP41155 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LtbP41155 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LtbP41155 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LtbP41155 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LtbP41155 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LtbP41155 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LtbP41155 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LtbP41155 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LtbP41155 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LtbP41155 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LtbP41155 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LtbP41155 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LtbP41155 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LtbP41155 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LtbP41155 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LtbP41155 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LtbP41155 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LtbP41155 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LtbP41155 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LtbP41155 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LtbP41155 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LtbP41155 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LtbP41155 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LtbP41155 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LtbP41155 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LtbP41155 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LtbP41155 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LtbP41155 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms