Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf2P39429 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf2P39429 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf2P39429 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf2P39429 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf2P39429 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf2P39429 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf2P39429 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf2P39429 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf2P39429 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf2P39429 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf2P39429 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf2P39429 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms