Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Grik2P39087 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grik2P39087 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grik2P39087 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grik2P39087 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grik2P39087 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grik2P39087 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grik2P39087 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grik2P39087 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grik2P39087 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grik2P39087 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grik2P39087 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grik2P39087 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Grik2P39087 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grik2P39087 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grik2P39087 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grik2P39087 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grik2P39087 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grik2P39087 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grik2P39087 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grik2P39087 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grik2P39087 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grik2P39087 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grik2P39087 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grik2P39087 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grik2P39087 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grik2P39087 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grik2P39087 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grik2P39087 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grik2P39087 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Grik2P39087 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grik2P39087 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grik2P39087 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Grik2P39087 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grik2P39087 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grik2P39087 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Grik2P39087 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grik2P39087 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grik2P39087 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grik2P39087 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grik2P39087 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grik2P39087 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grik2P39087 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grik2P39087 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grik2P39087 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grik2P39087 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grik2P39087 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grik2P39087 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grik2P39087 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grik2P39087 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms