Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptpn1P35821 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms