Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nedd1P33215 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nedd1P33215 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms