Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VtnP29788 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VtnP29788 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VtnP29788 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VtnP29788 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VtnP29788 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VtnP29788 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VtnP29788 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VtnP29788 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VtnP29788 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VtnP29788 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VtnP29788 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VtnP29788 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VtnP29788 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VtnP29788 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VtnP29788 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VtnP29788 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VtnP29788 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VtnP29788 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VtnP29788 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
VtnP29788 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
VtnP29788 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VtnP29788 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VtnP29788 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VtnP29788 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VtnP29788 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VtnP29788 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VtnP29788 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VtnP29788 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VtnP29788 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VtnP29788 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VtnP29788 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VtnP29788 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VtnP29788 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VtnP29788 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VtnP29788 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VtnP29788 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VtnP29788 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VtnP29788 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VtnP29788 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VtnP29788 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VtnP29788 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VtnP29788 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VtnP29788 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VtnP29788 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VtnP29788 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VtnP29788 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VtnP29788 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VtnP29788 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VtnP29788 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VtnP29788 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VtnP29788 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VtnP29788 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VtnP29788 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VtnP29788 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VtnP29788 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VtnP29788 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VtnP29788 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VtnP29788 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VtnP29788 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VtnP29788 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VtnP29788 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VtnP29788 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VtnP29788 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VtnP29788 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VtnP29788 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VtnP29788 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VtnP29788 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VtnP29788 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VtnP29788 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VtnP29788 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VtnP29788 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VtnP29788 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VtnP29788 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VtnP29788 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VtnP29788 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VtnP29788 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VtnP29788 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VtnP29788 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VtnP29788 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VtnP29788 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VtnP29788 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VtnP29788 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VtnP29788 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VtnP29788 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VtnP29788 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VtnP29788 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VtnP29788 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VtnP29788 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VtnP29788 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VtnP29788 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VtnP29788 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VtnP29788 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VtnP29788 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VtnP29788 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VtnP29788 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VtnP29788 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VtnP29788 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VtnP29788 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VtnP29788 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms