Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PtprmP28828 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PtprmP28828 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PtprmP28828 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PtprmP28828 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PtprmP28828 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PtprmP28828 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PtprmP28828 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PtprmP28828 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PtprmP28828 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PtprmP28828 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PtprmP28828 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PtprmP28828 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PtprmP28828 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PtprmP28828 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PtprmP28828 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PtprmP28828 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PtprmP28828 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PtprmP28828 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PtprmP28828 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PtprmP28828 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PtprmP28828 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PtprmP28828 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PtprmP28828 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PtprmP28828 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PtprmP28828 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PtprmP28828 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PtprmP28828 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PtprmP28828 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PtprmP28828 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PtprmP28828 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PtprmP28828 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PtprmP28828 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PtprmP28828 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PtprmP28828 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PtprmP28828 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PtprmP28828 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PtprmP28828 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PtprmP28828 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PtprmP28828 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PtprmP28828 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PtprmP28828 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PtprmP28828 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PtprmP28828 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PtprmP28828 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PtprmP28828 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PtprmP28828 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PtprmP28828 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PtprmP28828 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PtprmP28828 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PtprmP28828 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PtprmP28828 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PtprmP28828 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PtprmP28828 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PtprmP28828 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms