Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Aco1P28271 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Aco1P28271 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Aco1P28271 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aco1P28271 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aco1P28271 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aco1P28271 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aco1P28271 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aco1P28271 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aco1P28271 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms