Protein–RNA interactions for Protein: P25446

Fas, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FasP25446 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FasP25446 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FasP25446 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FasP25446 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FasP25446 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FasP25446 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FasP25446 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FasP25446 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FasP25446 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FasP25446 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FasP25446 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FasP25446 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FasP25446 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FasP25446 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FasP25446 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FasP25446 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FasP25446 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FasP25446 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FasP25446 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FasP25446 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FasP25446 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FasP25446 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FasP25446 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FasP25446 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FasP25446 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FasP25446 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FasP25446 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FasP25446 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FasP25446 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FasP25446 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FasP25446 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FasP25446 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FasP25446 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FasP25446 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FasP25446 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FasP25446 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FasP25446 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FasP25446 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FasP25446 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FasP25446 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FasP25446 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FasP25446 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FasP25446 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FasP25446 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FasP25446 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FasP25446 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FasP25446 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FasP25446 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FasP25446 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FasP25446 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FasP25446 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FasP25446 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FasP25446 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FasP25446 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FasP25446 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FasP25446 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FasP25446 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FasP25446 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FasP25446 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FasP25446 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FasP25446 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FasP25446 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FasP25446 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FasP25446 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FasP25446 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FasP25446 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FasP25446 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FasP25446 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FasP25446 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FasP25446 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FasP25446 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FasP25446 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FasP25446 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FasP25446 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FasP25446 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FasP25446 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FasP25446 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FasP25446 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FasP25446 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FasP25446 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FasP25446 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FasP25446 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FasP25446 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FasP25446 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FasP25446 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FasP25446 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FasP25446 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FasP25446 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FasP25446 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FasP25446 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FasP25446 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FasP25446 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FasP25446 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FasP25446 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FasP25446 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FasP25446 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FasP25446 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FasP25446 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FasP25446 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FasP25446 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms